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酵母雙雜交檢測(Yeast Two-Hybrid Assay)技術(shù)原理

酵母雙雜交系統(tǒng)(Yeast two-hybrid assay)技術(shù)原理

檢測原理:

   酵母雙雜交系統(tǒng)(Yeast two-hybrid assay)是用于體內(nèi)研究蛋白相互作用的一種非常便利的工具,常用的如GAL4為基礎(chǔ)的系統(tǒng),使用酵母轉(zhuǎn)錄因子GAL4來檢測轉(zhuǎn)錄激活后的蛋白相互作用。某些轉(zhuǎn)錄因子(如GAL4)由兩個可以分開,功能上相互獨立的結(jié)構(gòu)域組成,N端有一個147個氨基酸組成的DNA結(jié)合域(DNA binding domain,BD),C端有一個由113個氨基酸組成的轉(zhuǎn)錄激活域(transcription activation domain,AD)。BD可以和上游激活序列(UAS)結(jié)合,而AD能激活UAS下游基因進行轉(zhuǎn)錄。單獨的BD或AD不能激活基因轉(zhuǎn)錄,兩者只有通過某種方式結(jié)合在一起形成完整的轉(zhuǎn)錄激活因子的功能。酵母雙雜交系統(tǒng)主要利用酵母GAL4的這個特性通過兩個雜交蛋白在酵母細胞中的相互結(jié)合及對報告基因的轉(zhuǎn)錄激活來研究活細胞內(nèi)蛋白質(zhì)的相互作用,對蛋白質(zhì)之間微弱、瞬間的作用都能通過報告基因敏感的檢測到。
酵母雙雜交系統(tǒng)應(yīng)用:
對新的與已經(jīng)蛋白相互作用的鑒定
對預測蛋白相互作用的確認
對蛋白相互作用區(qū)域的鑒定

酵母雙雜交系統(tǒng)重要元件介紹(以Matchmarker GAL4-based two hybrid assay為例)
一、誘餌(the bait)
為了建立GAL4 DNA-BD/bait融合蛋白,推薦使用質(zhì)粒pGBKT7;
要調(diào)查三元蛋白復合物,推薦使用含2個MCS區(qū)域的三雜交載體,能表達GAL4 DNA-BD/bait融合蛋白和第二個感興趣蛋白,在bait和prey蛋白之間發(fā)揮橋梁作用。
二、檢測蛋白作用的四個報告基因
Matchmarker gold系統(tǒng)是采用4個報告基因/3個不同bait識別序列的雙雜交系統(tǒng)。其采用新型穩(wěn)定的酵母雙雜交抗生素- 金擔子素Aureobasidin A (AbA)(貨號:M0129),可有效殺死非抗性克隆,從而大大降低背景克隆生長。同時有效縮減假陽性,由于人和prey蛋白單獨將結(jié)合引起假陽性都需要識別3個不同序列,激活4個報告基因的表達。

4個報告基因分別是:1個AbA抗生素篩選報告基因,2個營養(yǎng)篩選報告基因,1個藍白斑篩選報告基因。

1)  AUR1-C
AUR1基因的主要突變版,能夠表達肌醇磷脂酰神經(jīng)酰胺合成酶(Inositol phosphorylceramide (IPC) synthase)。當?shù)鞍装l(fā)生作用促使GAL4轉(zhuǎn)錄激活,AUR1-C基因進行表達。釀酒酵母中此基因的表達孵育其對高毒抗生素金擔子素Aureobasidin A (AbA)的抗性。由于其背景極其低,這一篩選報告子由于單一的營養(yǎng)缺陷報告子。
2)  HIS3
Y2HGold菌株不能合成組氨酸,從而無法在缺少這一必須氨基酸的培養(yǎng)基上生長。當誘餌和誘捕蛋白相互作用,Gal4反應(yīng)性的His3表達促使細胞合成組氨酸并能在His缺陷培養(yǎng)基上生長。
3)  ADE2
Y2HGold菌株無法在不含腺嘌呤的基本培養(yǎng)基上生長,但當兩個蛋白相互作用,Ade2表達被活化,細胞能在Ade缺陷的基礎(chǔ)培養(yǎng)基上生長。
4)  MEL1
MEL1編碼α-半乳糖苷酶,存在許多酵母菌內(nèi)的天然表達蛋白。當雙雜交發(fā)生,MEL1表達和分泌,在底物X-α-Gal(貨號:M5831-100mg)存在的情況下,酵母菌落變?yōu)樗{色。
三、三個不同的結(jié)合位點(three different binding sites)
Y2HGold菌株三個啟動子控制4個報告基因是不相關(guān)的,除UAS區(qū)域的短蛋白結(jié)合位點特異性結(jié)合Gal4 DNA-BD。因此,誘捕蛋白(文庫蛋白或靶蛋白)與UAS內(nèi)部或邊緣的不相關(guān)序列作用(假陽性)就會自動被篩查出來。
 Matchmarker酵母菌株的報告基因構(gòu)造。Y2HGold中,HIS3,ADE2,MEL1,和AUR1-C報告基因分別由三個完全異源的Gal4反應(yīng)啟動元件-G1,G2,M1操控。而啟動子內(nèi)的蛋白結(jié)合位點是不同的,雖然每一個結(jié)合位點與Gal4識別的17-mer共有序列相關(guān)聯(lián)。
酵母雙雜交系統(tǒng)操作流程(以Matchmarker GAL4-based two hybrid assay為例)
完整的Matchmarker篩選過程包含以下步驟:
第一步:執(zhí)行對照實驗;
第二步:誘餌載體的構(gòu)建及自我激活和毒性檢測;
第三步:篩選Mate&Plate文庫

第四步:確認和闡釋結(jié)果

酵母雙雜相關(guān)產(chǎn)品:

貨號

產(chǎn)品

規(guī)格

單價/

M1397

IPTG  

10g

419

M6090

X-Gal

1g

426

M5831-100mg

X-α-Gal

100mg

1280

M5831-250mg

X-α-Gal

250mg

2199

S2705

MUG 4-甲基傘型酮-beta-D-葡糖苷酸

250mg

680

S2805

MUG 4-甲基傘型酮-beta-D-葡糖苷酸

1g

1780

M0129

Aureobasidin AAbA)金擔子素A 1mg/ml

1mg

1378

M0135

Aureobasidin A AbA)金擔子素A(凍干粉)

10mg

6800

M1405-1g

硫酸慶大霉素Gentamicin Sulfate Salt

1g

382

M1405-5g

硫酸慶大霉素Gentamicin Sulfate Salt

5g

1150

M8071

5-Fluoroorotic Acid (5-FOA) 5-氟乳清酸

1g

424

M8271

5-Fluoroorotic Acid (5-FOA) 5-氟乳清酸

5g

1524

M8471

5-Fluoroorotic acid monohydrate (5-FOA) 5-氟乳清酸一水合物

500mg

347

M8671

5-Fluoroorotic acid monohydrate (5-FOA) 5-氟乳清酸一水合物

1g

612


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